Sesto Calende occupava nell’Altomedioevo un ruolo centrale nel sistema di controllo economico e militare dal quadrante nord-occidentale lombardo. Proprio grazie alla costituzione del Museo é stato possibile salvaguardare importanti testimonianze del passato che altrimenti sarebbero andate irrimediabilmente perdute.

Sono andati dispersi i corredi relativi ad alcune sepolture di guerrieri di cultura longobarda, ritrovate tra la fine del XIX e l’inizio del XX sec.. Non é nota l’attuale collocazione di un paio di orecchini d’oro a cestello, un tempo conservati in una collezione privata milanese, e datati alla seconda metá del VI sec.. Sono depositate presso i Musei Civici di Varese alcune ceramiche longobarde, associate ad altre di tradizione romana, provenienti dalla frazione Legnate; i reperti dello scavo di S. Vincenzo sono invece custoditi presso la Soprintendenza Archeologica della Lombardia.

La sezione altomedievale del Museo ospita alcuni frammenti di marmo lavorato provenienti dall’abbazia di S. Donato in Scozola. A partire dal 1959 i restauri della chiesa e la sistemazione dell’area circostante hanno messo in luce plutei e piastrini, quasi tutti in marmo dolomitico, che componevano una recinzione, innalzata per separare il presbiterio dalla navata. Le lastre, decorate ad intreccio, presentano un’interessante commistione di elementi decorativi di sapore germanico con altri di tradizione tardoantica. La maggior parte degli studiosi concorda datare i pezzi alla prima metá del IX sec, in coincidenza con l’insediamento di una comunitá monastica, di origine pavese, presso S. Donato.

All’interno dell’esposizione, collocata al piano superiore del museo, sono presenti alcuni pannelli informativi che permettono di integrare la visione dei reperti con ampie schede sul loro contesto di origine.